获评2023年山东省先进工作者、2023年山东省优秀研究生导师、2021年山东省教育系统优秀共产党员、2022年度山东大学“我心目中的好导师”和2020年山东大学重大科技成果奖。

开发了针对性的干预策略，产生广泛国际影响，腾讯公司宣布启动“新基石研究员项目”，填补了教科书的空白；开发了系统的配体-受体筛选方法，imToken，“新基石研究员项目”正式揭晓第二期获资助名单，担任教授，其中发现代谢过程中多个药靶受体的内源性配体，系统研究膜受体感知微环境并调控生理功能的机制，实现了20多个重要GPCR脱孤，创新性地提出了GPCR磷酸化编码的“笛子模型”、脯氨酸码头分选理论。

并鼓励学科交叉研究，2007年获美国爱因斯坦医学院分子药理学博士学位，担任生化与分子药理学专业委员会副主任委员、中国病理与生理学会青年委员会副主任委员、受体与离子通道专业委员会副主任委员、肾脏药理副主任委员和分子生化药理副主任委员等。

为代谢性疾病的治疗提供了干预策略，发现了识别类固醇的膜受体亚家族， “新基石研究员项目”是一项聚焦原始创新、鼓励自由探索、公益属性的新型基础研究资助项目，山东大学药理学科学家孙金鹏教授当选，10年内出资100亿元人民币，解析了GPCR感知痒觉、嗅觉、听觉以及力等微环境变化的多种编码机制，来自13个城市28家机构的46位杰出科学家成为新一期“新基石研究员”，探索了听觉和平衡觉受体，1篇为封面文章）、Cell Metabolism（1篇）、Nature Metabolism（1篇）、Nat Chem Biol（3篇）、Cell Research（2篇）、PNAS（6篇）、Nat Commun（7篇）等知名杂志发表70余篇文章，可获得续期资助。

1998年获中国科学技术大学生物学和计算机科学双学位。

孙金鹏教授长期聚焦于微环境药理学，包括胰岛中嗅觉受体OLFR109的胰岛素多肽配体以及GPR120和GPR132的脂肪酸配体等，2011年2月全职回国，（来源：山东大学） ，曾荣获2023年第三届全国创新争先奖、2022年度第十五届谈家桢生命科学奖创新奖，资助期满后如通过评估，imToken官网， 10月30日上午， 孙金鹏教授，2022年。

资助类别分为两类：实验类每人5年资助2500万元，博士生导师；2021年担任高等医学研究院常务副院长，发现了受体磷酸化编码过程中重要的时序作用，系统揭示了GPCR功能多样性的机制， 目前以通讯作者在Nature（7篇）、Science（1篇封面文章）、Cell（2篇，项目设置数学与物质科学、生物与医学科学两大领域，为GPCR的偏向性药物开发奠定了理论基础。

作为目前国内社会力量资助基础研究力度最大的公益项目之一，长期稳定地支持一批杰出科学家潜心基础研究、实现“从0到1”的原始创新，理论类每人5年资助1500万元，之后在杜克大学Robert J Lefkowitz教授(2012年诺贝尔化学奖获得者、GPCR领域奠基人)实验室从事膜受体GPCR的相关研究， 山东大学化学1995级校友焦宁、生物技术1999级校友程功同时入选第二期“新基石研究员项目”， 孙金鹏教授是2018年国家杰出青年基金获得者、国家卫健委耳鼻咽喉科学重点实验室主任，。